红曲的起源与发展
中国是世界公认红曲生产与应用最早、最广的国家。
我国古籍及医药与饮食著作中有关红曲的记载很多，如被誉为“建安七子”之一王粲的《七释》、元代忽思慧的《饮膳正要》、明代宋应星之《天工开物》，以及明代李时珍的《本草纲目》中均可见红曲相关的描述，足证我国在饮食及医疗上应用红曲之久远。普通百姓家中，常用红曲于酿酒、酿醋，以及作为鱼、肉、豆制品的加工美味佐剂，实为我国先民之一大发明。
我国古籍及医药与饮食著作中有关红曲的记载很多，如被誉为“建安七子”之一王粲的《七释》、元代忽思慧的《饮膳正要》、明代宋应星之《天工开物》，以及明代李时珍的《本草纲目》中均可见红曲相关的描述，足证我国在饮食及医疗上应用红曲之久远。普通百姓家中，常用红曲于酿酒、酿醋，以及作为鱼、肉、豆制品的加工美味佐剂，实为我国先民之一大发明。
初级科技阶段
红曲的起源
中国利用红曲菌，历史悠久，据考证自汉代已用红曲制作红饭或腐乳了。至于红曲的具体制作，在明代李时珍的《本草纲目》和宋应星的《天工开物·下卷》中均有记载，诸家一致认为红曲性味甘温，具有活血化瘀，健脾消食之功效，主治产后恶露不净、瘀滞腹痛、食积饱胀、赤白下痢、跌打损伤等症。
中级科技阶段
菌种纯粹培养技术的采用
随着微生物培养技术的发达，采用微生物分离培养技术，从现有红曲或自然界中分离、筛选、纯化目标红曲菌种，取得了很好的成就，极大促进了红曲相关产业的发展，也为获得红曲菌的高经济价值代谢产物奠定了基础。
高级科技阶段
高经济价值代谢产物的开发生产
二次大战后，发酵工业突飞猛进，微生物应用技术不断创新，世界各国学者纷纷加入研究行列。红曲研究方面发现了很多高经济价值的代谢产物，例如通过红曲菌发酵获得安全的天然红曲色素；发现红曲菌的代谢产物具有降低胆固醇、调节血糖、血压、防癌等功效，重新认识红曲的药用功能。
古代常将红曲作为活血化瘀的良药
《中药大辞典》“活血化瘀，健脾消食；治产后恶露不尽，瘀滞腹痛，食积饱胀，赤白下痢及跌打损伤”即最大功效是活血化瘀，特别是对外伤的淤青，或者体内堆积的淤血十分有效，对于月经不调、痛经等也适用。
《饮膳正要》：健脾，益气，温中。《本草衍义补遗》：活血消食，健脾暖胃，赤白痢下水谷。
《本草纲目》：“治女人血气痛及产后恶血不尽，擂酒饮之良。《本草备要》：“入营而破血，燥胃消食，活血和血。治跌打损伤。《医林纂要▪药性》：解生冷物毒。
日本远藤章教授在红曲中发现莫纳克林K
莫纳克林K和洛伐他汀虽属同一物质，但红曲除含莫纳克林K之外还代谢多种物质，具有综合调脂疗效，效果更佳。
“降低胆固醇将有效降低冠心病的发病率和死亡率”
二次世界大战结束后美国经济高速发展，冠心病正是当时美国的第一大死亡原因，同期已有许多证据证实，降低胆固醇将有效降低冠心病的发病率和死亡率。
“莫纳克林K（Monacolin K）”
1973年日本的远藤章（被誉为“他汀”之父），从红色红曲菌的培养液中获得 了一种胆固醇合成抑制剂——莫纳克林K（Monacolin K），其后又从红色红曲菌的培养液中分离得到莫纳克林J、L、X、M和Dihydromonacolin L，后经证实，莫纳克林K和洛伐他汀属于同一物质。
人类医学史上的重大发现
他汀药物的出现，大大降低了心脑血管疾病患者的死亡率，众多学者认为，他汀与青霉素一样重要，都是人类医学史上的重大发现。在临床上应用的各种他汀类药物中，洛伐他汀和普伐他汀是微生物发酵或转化的天然化合物，其中防止效果最好的是莫纳克林K，可有效的抑制HMG-CoA还原酶。
随着洛伐他汀的上市，众多学者对红曲开始重视并进行深入的研究，开启了现代红曲研究时代。
红曲现代研究
随着对红曲应用研究的深入，学者们开始利用基因工程和发酵工程等手段改良现有原始菌株，来实现提高有益代谢物的产量，
降低有害代谢物的含量，促进红曲产业的发展。
随着社会的进步与科学技术的发展，现代生物科技已融入红曲的生产当中，与传统制法相比，现代制法有了极大的进步：
1、红曲菌种经过分离筛选、驯化后获得的优质纯菌种，而不是传统的自然接种，使得产品质量更高更安全，不会受到气候、地域等自然条件限制。
2、采用先进生产设备，环境更洁净，便于红曲生产的规模化，提高生产效率。
3、红曲生产过程中参数控制良好，可以获得质量、浓度较高的目标产物。
红曲的次级代谢物是近代的研究重点，人们已经在红曲次级代谢物中发现多种生理活性物质，其中重要的有红曲色素、莫纳克林K、抗腐败菌物质、长链脂肪酸、抗氧化物质、抗癌及增强免疫力物质等。
迄今被开发利用的主要有莫纳克林K、γ－氨基丁酸、麦角固醇等，研究人员可定向让红曲产生某一特定物质，极大推动了红曲在食品、保健品、药品中的应用。
